1、溶液组成不同
PB缓冲溶液：也叫磷酸盐缓冲溶液，是磷酸二氢钠和磷酸氢二钠，或磷酸氢二钠和磷酸二氢钾，按一定比例混合而成的不同浓度的缓冲溶液。
PBS缓冲液：也叫磷酸盐水缓冲溶液。是用磷酸的钠盐、磷酸钾盐和氯化钠按不同的比例配制而成。有时为了增加其水溶性,加入了非离子表面活性剂Tween-20和TritonX-100,简称为PBST或TPBS。
2、应用领域和功能不同
PB缓冲液：是最普通的缓冲溶液，在化学反应、合成反应等化学领域广泛应用。磷酸盐起着缓冲作用，用以维持一定的pH环境。但如果用PB冲洗细胞，会导致低渗吸水，甚至细胞胀破。所以要用于电泳或与细胞有关的缓冲体系时，则要用PBS缓冲液即磷酸盐水缓冲液，pH范围一般是在6.0-8.0。
PBS缓冲液：在PB缓冲液的基础上还加入氯化钠，该类缓冲溶液不仅具有良好缓冲作用，还具有很好的盐平衡能力，可以起到调节渗透压的作用。其主要作用为维持稳定的pH、维持渗透压及短时间提供基础营养，可以在短期内维持蛋白、细胞、组织、器官等有生物活性的产品活性，提供必要的营养环境。在生物实验中，其主要用途是漂洗、稀释、作为基础溶液配置其他溶液等，用途十分广泛，属于生物实验室必不可缺的一种试剂。
